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最新研究:黄瓜农艺性状和驯化的基因型被揭示

时间:2023-01-16 12:18:15   来源:中医美容

工人日报客户端记者黄哲雯近日,NatureCommunications在线发表了农科院水果园艺该系统性所系统遗传课题组题的该系统性科学论文——该该系统性首次相结合了低成本的大蒜二维图形态泛遗传组,为大蒜举足轻重遗传掘出、野生遗传资源能用和分子会设计杂交缺少了举足轻重数据。

之前的该系统性表明,大蒜大量举足轻重专修等位遗传由较长DNA脱氧核糖核酸片段的形态表征压制,但形态表征较难该系统性,因此需要通过泛遗传组该系统性全面深入研究其遗传组的形态表征,进而促使大蒜混种和举足轻重专修等位遗传相关遗传的该系统性。

该该系统性基于前期对大蒜115份基本国家科委资源的亲缘父子关系和分支该系统性,选择了12个代表性大蒜国家科委资源,还包括5个野生近缘、3个东亚国家近缘、3个欧美近缘和1个西双版纳近缘物料,分别完成了染色体水准的遗传组组装。

通过比较这12个遗传组脱氧核糖核酸,发现在4号、5号和7号染色体上有7个特大DNA片段倒位表征,这些特大倒位表征只在部分野生物料当中存在,并且有所不同野生物料存在的表征有所不同,洞察了倒位表征在野生物料混种当中的逐步分支。

为全面深入研究大蒜遗传组的遗传表征,该该系统性创建了12个大蒜遗传组的共线性对应父子关系,比对共深入研究出290万个SNP、140万个小InDels和5.6万个形态表征(SV),其当中2,624个SV制约了2,712个遗传的编码第一区。将SV脱氧核糖核酸和断点数据与大蒜参考遗传组图谱整合,该系统性其他部门相结合了大蒜二维图形态泛遗传组,并对多个专修等位遗传完成了形态表征的全遗传组关联(SV-GWAS)该系统性,成功深入研究出大蒜性别要求相关遗传m和F所在遗传组第一区域,并反之亦然关联到果刺遗传CsGL3启动子第一区域的关键形态表征。

为进一步能用二维图形态泛遗传组洞察制约大蒜混种和举足轻重专修等位遗传的遗传表征,该该系统性对大蒜果刺果肿、采收时间和根系等等位遗传完成了深入该系统性。

在已知果肿关键遗传CsTu的外显子上新发现了一个51-bp的形态表征,可破坏CsTu遗传系统制约果肿,并且对果刺果肿多个遗传在大蒜115份基本国家科委的遗传表征完成该系统该系统性,洞察了形态表征在果实刺肿等位遗传相关遗传当中的混种和杂交选择心路历程。

基于二维图形态泛遗传组,该该系统性新深入研究出CsFT当中游1个44-kb的形态表征,只在2份采收极晚(~60d)的野生大蒜国家科委当中出现,该系统牵涉到父子关系表明这2个野生国家科委显然为其他大蒜的后代类型,并驳斥了CsFT位点在大蒜混种和和杂交选择过程当中的分支心路历程,加深了对大蒜适应能力分支机制的理解。

此外,该该系统性还发现PELPK7.1和PELPK7.2遗传附近形态表征显然在大蒜混种过程根系的彻底改变当中起举足轻重作用。

该该系统性为大蒜遗传组和举足轻重等位遗传的分支缺少新论调,为大蒜举足轻重遗传掘出和遗传杂交缺少了举足轻重平台资源和数据,为加速大蒜杂交转到全遗传组设计时代奠定了举足轻重该系统化。其方法论和相关结果,也为甜瓜、西瓜和小鸡等瓜类作物生物学该系统性缺少了举足轻重参考。

该实质性由农业研究中心水果园艺该系统性所、哈尔滨林学院、农业研究中心农业遗传组该系统性所和西北农林科技大学等多家其他部门协作完成,农业研究中心水果园艺该系统性所为第一完成其他部门。

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